Лаборатория вирусных гепатитов создана 30 декабря 1986 г.

В течение девятнадцати лет (до 2015 г.) руководство лабораторией осуществлял профессор, доктор медицинских наук Сергей Леонидович Мукомолов. Основным направлением научной деятельности лаборатории было «Изучение эпидемиологической характеристики острых и хронических вирусных гепатитов».

Абсолютно новым аспектом в данной тематике являлся фрагмент по изучению вирусного гепатита С, которому посвящена диссертационная работа на соискание степени доктора медицинских наук С.Л. Мукомолова. Защита диссертации на тему: «Вирусный гепатит С. Клинико-эпидемиологическая и лабораторная характеристика» состоялась в 1994 г. и была признана пионерской.

В лаборатории разработан новый диагностический препарат, не уступающий зарубежным аналогам 2 поколения, послуживший основой для экспериментально-производственного регламента производства иммуноферментной тест-системы для обнаружения анти - ВГС (ЭПР  433-93, ВФС 42-391ВС -93), утвержденного МЗ РФ 06.05.93. С 1993 г. препарат стал выпускаться в промышленном масштабе.

За период 1986-1994 гг. в общей сложности опубликованы  25 печатных работ, включая зарубежные издания; материалы доложены на конференциях, в том числе зарубежных.

В 1996 г. в соответствии с Приказом Государственного Комитета санитарно-эпидемиологического надзора РФ № 134 от. 28.08.1996 г. на базе лаборатории вирусных гепатитов Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера создан «Научно-методический региональный центр по эпидемиологическому надзору за вирусными гепатитами». В том же году распоряжением заместителя Председателя Госкомсанэпиднадзора № 185-2 от 27.09.96 г. на Центр были возложены функции надзора на федеральном уровне. Руководство центром было возложено на профессора С.Л. Мукомолова.

С 1996 г. профессор Л.И. Шляхтенко продолжила свою трудовую деятельность в Институте имени Пастера, где активно на протяжении многих лет участвовала  в становлении и работе Центра.

Под руководством профессора С.Л. Мукомолова совместно с профессором Л.И. Шляхтенко «Центром» разработаны:

1. Положения и программа деятельности «Центра»;

2. Алгоритм сбора и анализа информации по надзору за вирусными гепатитами (всего 10 таблиц); алгоритм лег в основу электронной базы данных, которая используется с 2010 г. по настоящее время совместно с федеральным Референс-центром по вирусным гепатитам (Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии, Москва);

3. Организована система сбора информации по эпидемиологии вирусных гепатитов на различных территориях РФ совместно с  территориальными Управлениями Роспотребнадзора.

В 1997 г. вышел первый выпуск аналитического обзора «Вирусные гепатиты в Российской Федерации».

В период  1997-2016 гг. опубликовано 10 выпусков, в которых приводится подробный анализ эпидемиологической характеристики острых и хронических вирусных гепатитов в целом на территории РФ и особенности в отдельных территориях.

С 1998 г. лаборатория «Вирусных гепатитов» активно включается в  работу с международными организациями и получает грант в рамках Международной ассоциации развития сотрудничества с учеными различных стран по программе КОПЕРНИКУС.

В 1999 г. создана рабочая группа по молекулярной эпидемиологии вирусных гепатитов в странах Балтийского моря. В состав группы вошли ведущие учены из Германии, Дании, Латвии, Литвы, Норвегии, Польши, России, Финляндии, Швеции и Эстонии, осуществляющие свою научную деятельность по вышеуказанной тематике. Лаборатория начинает работать в рамках данного проекта. Молодые ученые получили возможность стажироваться в ведущих лабораториях мира, получены новые уникальные сведения по молекулярной эпидемиологии гепатитов А, В и С. Публикуются за рубежом первые статьи совместно с учеными других стран.

В 2011 г. вышла первая зарубежная монография по вирусным гепатитам под редакцией профессора С.Л. Мукомолова.

За время работы лаборатории защищены 19 диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук и три диссертации на соискание степени доктора медицинских наук.

​

С ноября 2015 г. заведование лабораторией «Вирусных гепатитов» и руководство «Научно-методическим центром по эпидемиологическому надзору за вирусными гепатитами» осуществляет профессор Е.В. Эсауленко.